Laureat pierwszej nagrody oraz nagrody publiczności na Międzynarodowym Konkursie Muzyki Kameralnej w Brugii, François Joubert-Caillet studiował u Paolo Pandolfo w Schola Cantorum Basiliensis (Bazylea, Szwajcaria).

Po wielu koncertach z różnymi zespołami wykonującymi muzykę dawną i nagraniach dla wytwórni Ricercar, Harmonia Mundi, Ambronay, K617, ZigZag Territoires, Arcana, Winter & Winter, Aparté, Glossa, Sony, Naïve i in. w 2009 roku założył grupę L’Achéron, z którą koncertuje na wielu scenach europejskich, m.in. w Saintes, Ambronay, Utrechcie, Paryżu, Brukseli, Atenach, Bazylei, Sablé, Ratyzbonie, Lozannie, Warszawie, Timisoarze, Wilnie i Malcie w różnych formacjach – od recitali na gambie po koncerty orkiestrowe czy konsort viol. François Joubert-Caillet nagrywa dla wytwórni Ricercar, w której wydał kilkanaście płyt CD.

Artysta pragnie zwrócić uwagę na muzykę mało znanych kompozytorów (Johannes Schenck, Anthony Holborne, Samuel Scheidt, Orlando Gibbons, Johann Bernhard Bach, Philipp Heinrich Erlebach), ale zaprasza także wsłuchania się w muzykę już znanego kompozytora, Marina Marais’a, którego wszystkie Pièces de viole nagrywa od 2014 roku (5 ksiąg, ponad 600 utworów, około 20 płyt CD). Nagrania te otrzymały wiele wyróżnień, m.in. Diapason d’Or, Choc de Classica czy Echo Klassik.

François Joubert-Caillet jest dziś kluczową postacią na scenie muzyki barokowej, zarówno ze względu na swoją „absolutną wirtuozerię” i „finezję gry”, jak i prowadzenie L’Achérona, z którym podąża śladami pionierów muzyki dawnej, odkrywa na nowo zapomniane cuda, inspirując się historycznymi praktykami, jednocześnie czyniąc je atrakcyjnymi dla dzisiejszej publiczności, a także znosząc granice pomiędzy muzyką a widzami za pomocą projektów przekrojowych (spotkania Orient-Occidental, muzyka współczesna lub popularna, improwizacja).